Отделение организовано осенью 1974 года.
С 1974 по 1977 заведующая отделением Софья Шафкетовна Рахимова.
В 1977- 1978 годы отделением заведовала д.м.н. Альфия Ахтямовна Курмаева.
С 1978 по 2004 год отделением заведовал к.м.н. Виль Мубарякович Ахметов.
С 2004 по 2018гг — к.м.н., врач высшей категории Альфия Узбековна Шагалина.
С января 2018года по ноябрь 2018 года зав.отд. врач аллерголог-иммунолог Кабирова Эльвира Филаретовна.
С ноября 2018 года по август 2020 заведующий отделением Борисова Алла Ивановна.
С августа 2020 года по настоящее время заведует врач аллерголог-иммунолог Кабирова Эльвира Филаретовна. В разные годы в отделении работали заслуженные врачи РБ Л.Г. Ваисова и З.Г. Усманова, к.м.н. С.Х. Чурмантаева, к.м.н. Э.Т. Валеева, врачи Р.М.
Латыпова, О.В. Голубева, С.М. Иммис, Р.З. Тимашева, д.м.н. Г.Р. Башарова.
Долгие годы старшей сестрой отделения работала Заслуженный медицинский работник РБ Мухаметкулова В.М., медицинские сестры Ревунова Г.Б., Закирова Р.М., Кутлугильдина З.М., санитарки Михайлова Н..И., Васильева Н.В., Петрова А.И.
В отделении развернуто 35 коек. В отделении проводится большая работа по углубленному обследованию и решению экспертных вопросов у больных с различными аллергическими и заболеваниями органов дыхания.
процедурная медсестра Шакирова Альмира Маратовна за работой
Этапы научно-практической работы
В условиях отделения в 1985-1987 годы выполнялись НИР и НПР по изучению условий труда и состояния здоровья работников Благовещенского биохимкомбината. Создана лаборатория по изучению состояния здоровья работников БВК, которую возглавляла д.м.н. Альфия Ахтямовна Курмаева.
Изучены условия труда и состояние здоровья работников производства синтетического каучука, промышленных катализаторов, резиново-технических изделий (к.м.н. В. М. Ахметов).
Изучены условия труда и состояние здоровья работников объединения «Химпром», подвергшихся влиянию диоксинов (д.м.н. Г. Р. Башарова).
В 1985-1986 годы проводилось исследование влияния сероводородных ванн в комплексном лечении больных вибрационной болезнью и хронической интоксикацией нефтепродуктами (к.м.н. Э. Т. Валеева).
В условиях отделения проводилось углубленное обследование состояния здоровья более тысячи вахтовиков Уфанефти (З.Г. Усманова). Работа выполнялась с выездом в Сургут и Когалым. Исследование завершилось разработкой санитарно-гигиенических, лечебно-оздоровительных мероприятий для лиц, работающих в условиях крайнего Севера.
В отделении впервые была апробирована методика лечения больных бронхиальной астмой методом лечебного голодания (Р.З.Тимашева).
В 2002-2004 годы проводилось исследование иммунного гомеостаза больных бронхиальной астмой среднетяжелого и тяжелого течения, разработаны схемы иммунокоррекции с применением отечественного иммунокорригирующего препарата полиоксидоний (к.м.н. А.У. Шагалина). В 2006-2009 годы проводилось изучение генетических маркеров у больных профессиональным бронхитом (С. Р. Мингазова).
В 2023 году отделение профессиональной аллергологии и иммунореабилитации переименовано в отделение профессиональной пульмонологии, аллергологии и иммунологии
В отделении в разные годы были защищены 2 докторские, 6 кандидатских диссертаций. Более 100 опубликованных научных трудов (статьи, монографии, методические рекомендации).
В настоящее время на базе отделения ведется сбор материала для выполнения диссертационных работ на темы «Клинико-функциональное значение дисфункции вегетативной нервной системы у больных с различными фенотипами среднетяжелой бронхиальной астмы» и «Разработка системы управления кардиоваскулярным риском у работников горно-обогатительного комбината», а также «Профессиональный риск нарушений здоровья работников автомобилестроения и меры их профилактики».